一、角膜血管化
角膜血管化是诱发排斥反应的最常见因素.在穿透性角膜移植术后一年内,有严重新生血管的角膜白斑,术后由于免疫排斥而失败的患者占20%-50%,而正常对照组为0%-10%.一般认为深层血管比浅层血管更易引起排斥.动物实验证实血管化角膜中有淋巴管存在,通过此途径移植抗原很容易导致受体致敏.另外,受体的免疫活性细胞也很容易通过血管和淋巴管进入植片.    

二、.第二次移植
第二次移植增加了发生排斥反应的危险性,发生原因不清.一种可能性是受体对第一次供体的一种或多种非HLA抗原发生了致敏，而新供体也存在有这种或这些抗原。另外，第一次手术的后遗症{新生血管和粘连}以及第二次移植的植片比第一次大，也是促发排斥反应的因素。

三、植片的大小和位置
小植片发生排斥反应较少。相反，超过7.50~8.00mm的大植片发生排斥反应率比较高。可能是因为植片越大越接近植床附近的血管和淋巴组织。另外，大植片所携带的抗原量也比较大。同样原因，偏心移植也易发生排斥反应。

四、植床的炎症背景
如果受体在移植前存在着炎症，如单疱病毒性角膜炎，可增加排斥反应的机会。炎症的存在常可导致角膜水肿.新生血管，从而使植床充满免疫活性细胞和抗体，特别是诱导lc的进入，加速了受体对供体抗原的识别和破坏过程。